wonambi package

Wonambi main module

Subpackages

• wonambi.attr package
  • Submodules
    • wonambi.attr.anat module
      • Brain
      • Freesurfer
      • Surf
      • import_freesurfer_LUT()
    • wonambi.attr.annotations module
      • Annotations
      • create_annotation()
      • create_empty_annotations()
      • parse_iso_datetime()
      • update_annotation_version()
    • wonambi.attr.chan module
      • Chan
      • Channels
      • assign_region_to_channels()
      • create_sphere_around_elec()
      • detect_format()
      • find_chan_in_region()
      • find_channel_groups()
• wonambi.bids package
  • Submodules
    • wonambi.bids.find module
      • possible_filenames()
      • powerset()
      • walk()
    • wonambi.bids.structure module
      • BIDSEEG
      • BIDSMain
      • BIDSName
      • build_name()
    • wonambi.bids.utils module
      • get_json()
      • get_tsv()
      • read_tsv()
• wonambi.bin package
  • Submodules
    • wonambi.bin.convert module
      • main()
    • wonambi.bin.scroll_data module
      • MainWindow
      • main()
• wonambi.detect package
  • Submodules
    • wonambi.detect.agreement module
      • MatchedEvents
      • consensus()
      • consensus_exact()
      • match_events()
    • wonambi.detect.arousal module
      • DetectArousal
      • detect_HouseDetector()
      • make_arousals()
      • splitpoint()
    • wonambi.detect.ripple module
      • DetectRipple
    • wonambi.detect.slowwave module
      • DetectSlowWave
      • detect_Massimini2004()
      • detect_Ngo2015()
      • detect_Staresina2015()
      • find_intervals()
      • find_peaks_in_slowwwave()
      • find_zero_crossings()
      • make_slow_waves()
      • select_peaks()
    • wonambi.detect.spindle module
      • DetectSpindle
      • define_threshold()
      • detect_Concordia()
      • detect_FASST()
      • detect_Ferrarelli2007()
      • detect_Lacourse2018()
      • detect_Martin2013()
      • detect_Moelle2011()
      • detect_Nir2011()
      • detect_Ray2015()
      • detect_UCSD()
      • detect_Wamsley2012()
      • detect_events()
      • make_spindles()
      • merge_close()
      • peak_in_power()
      • peaks_in_time()
      • power_in_band()
      • power_ratio()
      • remove_straddlers()
      • select_events()
      • transform_signal()
      • within_duration()
• wonambi.ioeeg package
  • Submodules
    • wonambi.ioeeg.abf module
      • Abf
    • wonambi.ioeeg.bci2000 module
      • BCI2000
    • wonambi.ioeeg.bids module
      • BIDS
      • write_bids()
      • write_bids_channels()
    • wonambi.ioeeg.blackrock module
      • BlackRock
    • wonambi.ioeeg.brainvision module
      • BrainVision
      • write_brainvision()
    • wonambi.ioeeg.edf module
      • Edf
      • remove_datetime()
      • write_edf()
    • wonambi.ioeeg.eeglab module
      • EEGLAB
    • wonambi.ioeeg.egimff module
      • EgiMff
      • ns()
      • parse_xml()
      • read_all_block_hdr()
      • read_block_hdr()
      • xml2dict()
      • xml2list()
    • wonambi.ioeeg.fieldtrip module
      • FieldTrip
      • write_fieldtrip()
    • wonambi.ioeeg.ktlx module
      • Ktlx
      • convert_sample_to_video_time()
      • get_date_idx()
    • wonambi.ioeeg.lyonrri module
      • LyonRRI
    • wonambi.ioeeg.micromed module
      • Micromed
    • wonambi.ioeeg.mnefiff module
      • write_mnefiff()
    • wonambi.ioeeg.moberg module
      • Moberg
    • wonambi.ioeeg.openephys module
      • OpenEphys
    • wonambi.ioeeg.text module
      • Text
    • wonambi.ioeeg.utils module
      • decode()
      • read_hdf5_chan_name()
      • read_hdf5_str()
    • wonambi.ioeeg.wonambi module
      • Wonambi
      • write_wonambi()
• wonambi.source package
  • Submodules
    • wonambi.source.linear module
      • Linear
      • calc_one_vert_gauss()
      • calc_one_vert_inverse()
      • calc_xyz2surf()
      • gauss()
    • wonambi.source.morph module
      • Morph
• wonambi.trans package
  • Subpackages
    • wonambi.trans.extern package
      • Submodules
  • Submodules
    • wonambi.trans.analyze module
      • event_params()
      • export_event_params()
      • export_freq()
      • export_freq_band()
    • wonambi.trans.baseline module
      • apply_baseline()
    • wonambi.trans.filter module
      • convolve()
      • filter_()
    • wonambi.trans.frequency module
      • band_power()
      • frequency()
      • morlet()
      • timefrequency()
    • wonambi.trans.math module
      • dB()
      • get_descriptives()
      • math()
    • wonambi.trans.merge module
      • concatenate()
    • wonambi.trans.montage module
      • compute_average_regress()
      • create_bipolar_chan()
      • create_virtual_channel()
      • montage()
    • wonambi.trans.peaks module
      • get_slopes()
      • peaks()
    • wonambi.trans.reject module
      • rejectbadchan()
      • remove_artf_evts()
    • wonambi.trans.select module
      • Segments
      • fetch()
      • get_times()
      • resample()
      • select()
      • smart_chan()
• wonambi.utils package
  • Submodules
    • wonambi.utils.exceptions module
      • MissingDependency
      • UnrecognizedFormat
    • wonambi.utils.simulate module
      • create_channels()
      • create_data()
      • f()
• wonambi.widgets package
  • Submodules
    • wonambi.widgets.analysis module
      • AnalysisDialog
      • PlotCanvas
      • PlotDialog
    • wonambi.widgets.channels module
      • Channels
      • ChannelsGroup
      • ConfigChannels
    • wonambi.widgets.creation module
      • create_actions()
      • create_menubar()
      • create_toolbar()
      • create_widgets()
    • wonambi.widgets.detect_dialogs module
      • SWDialog
      • SpindleDialog
    • wonambi.widgets.info module
      • ExportDatasetDialog
      • Info
    • wonambi.widgets.labels module
      • Labels
    • wonambi.widgets.modal_widgets module
      • ChannelDialog
      • DateTimeDialog
      • SVGDialog
    • wonambi.widgets.notes module
      • ConfigNotes
      • ExportEventsDialog
      • MergeDialog
      • NewUserDialog
      • Notes
    • wonambi.widgets.overview module
      • ConfigOverview
      • Overview
    • wonambi.widgets.settings module
      • Config
      • ConfigUtils
      • HelpDialog
      • Settings
      • read_settings()
    • wonambi.widgets.spectrum module
      • ConfigSpectrum
      • Spectrum
    • wonambi.widgets.traces module
      • ConfigTraces
      • Traces
      • take_raw_name()
    • wonambi.widgets.utils module
      • FormBool
      • FormDir
      • FormFloat
      • FormInt
      • FormList
      • FormMenu
      • FormRadio
      • FormSpin
      • FormStr
      • Path
      • RectMarker
      • TextItem_with_BG
      • choose_file_or_dir()
      • convert_name_to_color()
      • export_graphics()
      • export_graphics_to_svg()
      • freq_from_str()
      • keep_recent_datasets()
      • select_session()
      • short_strings()
      • stdicon()
    • wonambi.widgets.video module
      • ConfigVideo
      • Video

Submodules

• wonambi.dataset module
  • Dataset
    • Dataset.filename
    • Dataset.IOClass
    • Dataset.header
    • Dataset.dataset
    • Dataset.read_data()
    • Dataset.read_markers()
    • Dataset.read_videos()
  • detect_format()
• wonambi.datatype module
  • ChanFreq
  • ChanTime
  • ChanTimeFreq
  • Data
    • Data.data
    • Data.axis
    • Data.s_freq
    • Data.start_time
    • Data.attr
    • Data.export()
    • Data.index_of()
    • Data.list_of_axes
    • Data.number_of()
• wonambi.graphoelement module
  • Arousals
    • Arousals.events
  • Graphoelement
    • Graphoelement.chan_name
    • Graphoelement.to_annot()
    • Graphoelement.to_data()
  • Ripple
  • SlowWaves
    • SlowWaves.events
  • Spindles
    • Spindles.mean
    • Spindles.std
    • Spindles.det_value
    • Spindles.sel_value
    • Spindles.events
  • events_from_csv()